Banyak program keagamaan yang dikembangkan di lingkungan SD Islam Al-Azhar BSD. Setidaknya ada 8 jalur pembinaan keagamaan, baik yang bersifat intra maupun ekstrakurikuler, antara lain : 

1. Pembelajaran Agama ( Reguler di kelas )

2. Tadarus, Iqra dan Khataman

3. PHBI4. Peslat

5. SKAI

6. Peribadatan/Shalat Dzuhur Berjamaa

7. Iklim Sekolagh

8. Nilai-nilai Akhlak